日本で協同組合と呼ばれる組織は農業協同組合（ＪＡ）のほかにも、漁業協同組合（ＪＦ）や森林組合（森組）、生活協同組合（生協）、中小企業等協同組合（中小企協）などいろいろあります。それぞれ準拠する法律に基づいて組織する者や事業内容等を規定しています。

また、協同組合は組織する者が生産を行っているかどうかによって、生産者の協同組合と消費者の協同組合とに分類することができます。例えば、ＪＡ・ＪＦ・森組などは生産者の協同組合であり、生協は消費者の協同組合となります。